ユーザーを指定してSSH
ssh user@url
ユーザーを指定してフォルダー毎コピー
scp -r [folder] [user_name]@example.com:/home/[user_name]/www/webapp/[new folder name]
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scp -r [folder] [user_name]@example.com:/home/[user_name]/www/webapp/[new folder name]